呂宋鰻和鱸鰻外觀極為相似，但是可以經由背鰭起點(d=吻端至背鰭起點的距離)至肛門(a=吻端至肛門的距離)之間的距離，和身體全長(t=全長)的比例[p=(d-a)/t(%)]來區分，呂宋鰻的平均比(p=11.2%；變化範圍為9.4%~12.3%，n=8)比鱸鰻的平均比值(p=16.0%；變化範圍為14.1%~18.1%，n=8)有所差異；以及背鰭起點位於脊椎骨位置，前者約第24節處，後者約第21節處。

呂宋鰻和鱸鰻同屬於體色具有許多斑塊的淡水域鰻魚。本種肉食性，幼苗於臺灣北部及中部野外有採獲記錄，成鰻則於蘭嶼有發現記錄。主要是在夏季裡洄游至菲律賓沿海地區，因此推估繁殖季節應該在冬春之際。在冬季發現的鰻苗數量則較少，繁殖場所在位置仍不清楚。 

分布於西太平洋。主要在菲律賓呂宋島附近，臺灣及中國也有紀錄。 

本種在臺灣主要是混生於鰻苗洄游群當中。水產試驗所淡水繁養殖研究中心曾於2009年12月至2011年7月間，利用DNA萃取及序列的比對技術檢驗分別採自宜蘭、苗栗及彰化等地7梯次共405尾的黑鰻鰻線，測定出鱸鰻371尾(佔91.7%)、短鰭鰻30尾(7.4%)、呂宋鰻3尾(0.7)與西里伯斯鰻1尾(0.2%)，可見本種數量並不多，同時在野外的成魚可能更少，但是在菲律賓原生的應該有相當大量的族群。