科號	科名	科中文	學名	中文名	標本筆數	標本尾數
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Apogon doederleini	稻氏天竺鯛	69	192
	F189	Chlorophthalmidae	青眼魚科	Chlorophthalmus nigromarginatus	黑緣青眼魚	69	126
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Chaetodon auriga	揚旛蝴蝶魚	69	162
	F084	Muraenesocidae	海鰻科	Muraenesox cinereus	灰海鰻	69	108
	F310	Triglidae	角魚科	Pterygotrigla hemisticta	尖棘角魚	70	95
	F079	Muraenidae	鯙科	Echidna polyzona	多環蝮鯙	70	175
	F182	Stomiidae	巨口魚科	Astronesthes lucifer	螢光星衫魚	70	182
	F492	Paralichthyidae	牙鮃科	Pseudorhombus pentophthalmus	五眼斑鮃	70	119
	F447	Blenniidae	鳚科	Praealticus tanegasimae	種子島矮冠鳚	70	258
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Chrysiptera glauca	灰刻齒雀鯛	70	390
	F361	Coryphaenidae	鱰科	Coryphaena hippurus	鬼頭刀	70	126
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Heniochus acuminatus	白吻雙帶立旗鯛	70	179
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Benthosema pterotum	七星底燈魚	71	1084
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Apogon sp.	天竺鯛	71	126
	F102	Cyprinidae	鯉科	Candidia barbatus	台灣縱紋鱲	72	220
	F332	Moronidae	狼鱸科	Lateolabrax japonicus	日本花鱸	72	265
	F295	Syngnathidae	海龍科	Hippocampus trimaculatus	三斑海馬	72	85
	F412	Labridae	隆頭魚科	Thalassoma purpureum	紫錦魚	72	155
	F466	Scatophagidae	金錢魚科	Scatophagus argus	金錢魚	72	126
	F486	Osphronemidae	絲足鱸科	Macropodus opercularis	蓋斑鬥魚	72	223
	F282	Holocentridae	金鱗魚科	Sargocentron ittodai	銀帶棘鱗魚	72	79
	F097	Clupeidae	鯡科	Sardinella lemuru	黃澤小沙丁魚	73	168
	F074	Anguillidae	鰻鱺科	Anguilla japonica	日本鰻鱺	73	381
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres margaritaceus	斑點海豬魚	73	278
	F306	Aploactinidae	絨皮鮋科	Erisphex pottii	絨鮋	74	199
	F412	Labridae	隆頭魚科	Coris gaimard	蓋馬氏盔魚	74	122
	F081	Ophichthidae	蛇鰻科	Gen. sp(ophichthidae)	蛇鰻	75	134
	F351	Priacanthidae	大眼鯛科	Pristigenys niphonia	日本大鱗大眼鯛	75	95
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Pomacentrus coelestis	霓虹雀鯛	75	271
	F364	Carangidae		Decapterus maruadsi	藍圓鰺	76	98
	F364	Carangidae		Trachurus japonicus	日本竹筴魚	76	168
	F381	Sciaenidae	石首魚科	Pennahia macrocephalus	大頭白姑魚	76	93
	F366	Leiognathidae	鰏科	Gazza minuta	小牙鰏	76	187
	F373	Gerreidae	鑽嘴魚科	Gerres filamentosus	曳絲鑽嘴魚	76	136
	F435	Pinguipedidae	虎鱚科	Parapercis sexfasciata	六帶擬鱸	77	145
	F510	Diodontidae	二齒魨科	Diodon holocanthus	六斑二齒魨	77	585
	F102	Cyprinidae	鯉科	Cyprinus carpio carpio	西鯉	77	153
	F222	Ophidiidae	鼬魚科	Neobythites stigmosus	多斑新鼬鳚	77	174
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Plectroglyphidodon leucozonus	白帶固曲齒鯛	77	201
	F494	Bothidae	鮃科	Bothus myriaster	繁星鮃	77	132
	F095	Engraulidae	鯷科	Gen. sp(Engraulidae)	鯷科	77	1373
	F443	Uranoscopidae	膽星魚科	Uranoscopus japonicus	日本鰧	78	153
	F412	Labridae	隆頭魚科	Thalassoma quinquevittatum	五帶錦魚	78	99
	F503	Triacanthodidae	擬三棘魨科	Triacanthodes anomalus	擬三棘魨	78	118
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Gen. sp(Synodontidae)	狗母魚科	78	462
	F199	Neoscopelidae	新燈籠魚科	Neoscopelus microchir	小鰭新燈魚	79	144
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis bandanensis	黑星紫胸魚	79	153
	F159	Bagridae	鮠科	Tachysurus adiposalis	長脂瘋鱨	79	214
	F102	Cyprinidae	鯉科	Hemiculter leucisculus		79	660
	F412	Labridae	隆頭魚科	Cheilinus trilobatus	三葉唇魚	79	93
	F399	Terapontidae	鯻科	Pelates quadrilineatus	四帶牙鯻	80	147
	F069	Elopidae	海鰱科	Elops machnata	大眼海鰱	80	403
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres trimaculatus	三斑海豬魚	80	225
	F381	Sciaenidae	石首魚科	Atrobucca nibe	黑	81	153
	F079	Muraenidae	鯙科	Gymnothorax fimbriatus	花鰭裸胸鯙	82	142
	F364	Carangidae		Caranx sexfasciatus	六帶鰺	82	149
	F079	Muraenidae	鯙科	Echidna nebulosa	星帶蝮鯙	83	135
	F364	Carangidae		Gen. sp(Carangidae)	鰺科	83	193
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Apogon cookii	庫氏天竺鯛	83	335
	F412	Labridae	隆頭魚科	Anampses caeruleopunctatus	青斑阿南魚	84	104
	F467	Siganidae	臭肚魚科科	Siganus fuscescens	褐臭肚魚	84	200
	F106	Cobitidae	鰍科	Misgurnus anguillicaudatus	泥鰍	85	211
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Sinogastromyzon puliensis	埔里中華爬岩鰍	85	273
	F102	Cyprinidae	鯉科	Zacco platypus	平頜鱲	85	506
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Gen. sp(scorpaenidae)	鮋科	86	683
	F351	Priacanthidae	大眼鯛科	Priacanthus macracanthus	大棘大眼鯛	86	253
	F023	Scyliorhinidae	貓鯊科	Galeus sauteri	梭氏蜥鯊	87	252
	F338	Serranidae	鮨科	Epinephelus quoyanus	玳瑁石斑魚	87	272
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius maculafasciatus	斑帶吻鰕虎	88	8750
	F070	Megalopidae	大眼海鰱科	Megalops cyprinoides	大海鰱	89	918
	F412	Labridae	隆頭魚科	Thalassoma hardwicke	哈氏錦魚	89	116
	F245	Mugilidae	鯔科	Mugil cephalus	鯔	89	229
	F394	Pomacanthidae	蓋刺魚科	Pomacanthus semicirculatus	疊波蓋刺魚	90	161
	F227	Lophiidae	鮟鱇科	Lophiomus setigerus	黑口鮟鱇	90	125
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Sebastiscus marmoratus	石狗公	90	301
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Chaetodon vagabundus	飄浮蝴蝶魚	90	228
	F245	Mugilidae	鯔科	Chelon macrolepis	大鱗龜鮻	91	284
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres marginatus	緣鰭海豬魚	91	204
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Bathygobius fuscus	褐深鰕虎	92	439
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres melanochir	黑腕海豬魚	92	209
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Hemimyzon formosanus	臺灣間爬岩鰍	92	467
	F447	Blenniidae	鳚科	Gen. sp(Blenniidae)	鳚	93	244
	F095	Engraulidae	鯷科	Encrasicholina punctifer	銀灰半稜鯷	94	1044
	F457	Eleotridae	塘鱧科	Eleotris acanthopoma	刺蓋塘鱧	94	242
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis interrupta	斷帶紫胸魚	95	557
	F502	Cynoglossidae	舌鰨科	Symphurus orientalis	東方無線鰨	96	344
	F475	Scombridae	鯖科	Auxis rochei rochei	圓花鰹	97	2593
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius giurinus	極樂吻鰕虎	98	410
	F494	Bothidae	鮃科	Gen. sp(Bothidae)	鮃科	98	265
	F095	Engraulidae	鯷科	Encrasicholina heteroloba	異葉半稜鯷	100	879
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Scorpaenodes guamensis	關島小鮋	101	254
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres hortulanus	雲斑海豬魚	101	135
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Gen. sp(Sillaginidae)	沙鮻科	101	559
	F074	Anguillidae	鰻鱺科	Anguilla marmorata	花鰻鱺	102	3722
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Gen. sp(Myctophidae)	燈籠魚科	102	530
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Setarches longimanus	長臂囊頭鮋	106	205
	F412	Labridae	隆頭魚科	Thalassoma lutescens	胸斑錦魚	108	129
	F228	Antennariidae	躄魚科	Antennarius striatus	條紋躄魚	111	207
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Crossostoma lacustre	臺灣纓口鰍	112	414
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Sillago sihama	多鱗沙鮻	112	793
	F470	Acanthuridae	刺尾鯛科	Acanthurus triostegus	綠刺尾鯛	115	659
	F447	Blenniidae	鳚科	Istiblennius lineatus	線紋蛙鳚	116	320
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Gen. sp(Apogonidae)	天竺鯛	117	529
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius sp.	吻鰕虎	117	539
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Amphiprion clarkii	克氏雙鋸魚	119	163
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis trilineata	三線紫胸魚	119	386
	F102	Cyprinidae	鯉科	Pseudorasbora parva	羅漢魚	121	658
	F399	Terapontidae	鯻科	Terapon jarbua	花身鯻	129	316
	F474	Trichiuridae	帶魚科	Trichiurus lepturus	白帶魚	130	507
	F159	Bagridae	鮠科	Pseudobagrus brevianalis	短臀擬鱨	131	563
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Sicyopterus japonicus	日本瓢鰭鰕虎	136	4220
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Abudefduf sordidus	梭地豆娘魚	137	366
	F447	Blenniidae	鳚科	Istiblennius edentulus	暗紋蛙鳚	148	418
	F102	Cyprinidae	鯉科	Carassius auratus auratus	鯽	149	331
	F366	Leiognathidae	鰏科	Gen. sp(Leiognathidae)	鰏科	165	3032
	F095	Engraulidae	鯷科	Engraulis japonicus	日本鯷	168	2557
	F102	Cyprinidae	鯉科	Acrossocheilus paradoxus	臺灣石	169	731
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Abudefduf vaigiensis	條紋豆娘魚	174	806
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Trachinocephalus myops	大頭花桿狗母	174	641
	F102	Cyprinidae	鯉科	Opsariichthys pachycephalus	粗首馬口鱲	203	1333
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Gen. sp(Gobiidae)	鰕虎	500	1506