科號	科名	科中文	學名	中文名	標本筆數	標本尾數
	F159	Bagridae	鮠科	Pseudobagrus brevianalis	短臀擬鱨	61	340
	F102	Cyprinidae	鯉科	Pseudorasbora parva	羅漢魚	41	236
	F102	Cyprinidae	鯉科	Opsariichthys pachycephalus	粗首馬口鱲	37	186
	F102	Cyprinidae	鯉科	Acrossocheilus paradoxus	臺灣石	35	143
	F102	Cyprinidae	鯉科	Carassius auratus auratus	鯽	32	66
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius sp.	吻鰕虎	31	89
	F102	Cyprinidae	鯉科	Zacco platypus	平頜鱲	29	147
	F102	Cyprinidae	鯉科	Hemiculter leucisculus		22	101
	F102	Cyprinidae	鯉科	Microphysogobio alticorpus	高身小鰾鮈	20	53
	F159	Bagridae	鮠科	Tachysurus adiposalis	長脂瘋鱨	20	64
	F102	Cyprinidae	鯉科	Rhodeus ocellatus ocellatus	高體鰟鮍	20	118
	F102	Cyprinidae	鯉科	Candidia barbatus	台灣縱紋鱲	18	74
	F102	Cyprinidae	鯉科	Abbottina rivularis	棒花魚	18	108
	F102	Cyprinidae	鯉科	Tanakia himantegus	革條田中鰟鮍	14	97
	F102	Cyprinidae	鯉科	Phoxinus lagowskii	長尾鱥	13	107
	F102	Cyprinidae	鯉科	Gobiobotia cheni	陳氏鰍鮀	12	41
	F366	Leiognathidae	鰏科	Leiognathus splendens	黑邊鰏	11	65
	F106	Cobitidae	鰍科	Cobitis taenia	花鰍	10	21
	F102	Cyprinidae	鯉科	Varicorhinus barbatulus	臺灣突吻魚	10	21
	F366	Leiognathidae	鰏科	Secutor ruconius	仰口鰏	10	41
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Barbatula barbatula	條鬚鰍	10	34
	F102	Cyprinidae	鯉科	Cyprinus carpio carpio	西鯉	9	37
	F102	Cyprinidae	鯉科	Squalidus iijimae	飯島氏銀鮈	9	26
	F102	Cyprinidae	鯉科	Metzia formosae	臺灣梅氏鯿	9	58
	F106	Cobitidae	鰍科	Cobitis sinensis	中華鰍	8	20