科號	科名	科中文	學名	中文名	標本筆數	標本尾數
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius maculafasciatus	斑帶吻鰕虎	88	8750
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Sicyopterus japonicus	日本瓢鰭鰕虎	136	4220
	F074	Anguillidae	鰻鱺科	Anguilla marmorata	花鰻鱺	102	3722
	F330	Ambassidae	雙邊魚科	Ambassis buruensis	布魯雙邊魚	68	3596
	F366	Leiognathidae	鰏科	Gen. sp(Leiognathidae)	鰏科	165	3032
	F245	Mugilidae	鯔科	Gen. sp(Mugilidae)	鯔科	59	3007
	F475	Scombridae	鯖科	Auxis rochei rochei	圓花鰹	97	2593
	F095	Engraulidae	鯷科	Engraulis japonicus	日本鯷	168	2557
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Gen. sp(Gobiidae)	鰕虎	500	1506
	F095	Engraulidae	鯷科	Gen. sp(Engraulidae)	鯷科	77	1373
	F102	Cyprinidae	鯉科	Opsariichthys pachycephalus	粗首馬口鱲	203	1333
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Benthosema pterotum	七星底燈魚	71	1084
	F097	Clupeidae	鯡科	Sardinella sp.	沙丁魚	48	1060
	F095	Engraulidae	鯷科	Encrasicholina punctifer	銀灰半稜鯷	94	1044
	F070	Megalopidae	大眼海鰱科	Megalops cyprinoides	大海鰱	89	918
	F095	Engraulidae	鯷科	Encrasicholina heteroloba	異葉半稜鯷	100	879
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Abudefduf vaigiensis	條紋豆娘魚	174	806
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Sillago sihama	多鱗沙鮻	112	793
	F373	Gerreidae	鑽嘴魚科	Gen. sp(Gerreidae)	鑽嘴魚科	50	760
	F102	Cyprinidae	鯉科	Acrossocheilus paradoxus	臺灣石	169	731
	F330	Ambassidae	雙邊魚科	Ambassis sp.	雙邊魚	49	704
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Gen. sp(scorpaenidae)	鮋科	86	683
	F102	Cyprinidae	鯉科	Puntius semifasciolatus	半紋小鲃	67	681
	F102	Cyprinidae	鯉科	Hemiculter leucisculus		79	660
	F470	Acanthuridae	刺尾鯛科	Acanthurus triostegus	綠刺尾鯛	115	659
	F102	Cyprinidae	鯉科	Pseudorasbora parva	羅漢魚	121	658
	F366	Leiognathidae	鰏科	Secutor sp.	仰口鰏	8	642
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Trachinocephalus myops	大頭花桿狗母	174	641
	F366	Leiognathidae	鰏科	Secutor ruconius	仰口鰏	60	638
	F374	Haemulidae	石鱸科	Pomadasys sp.	石鱸	20	613
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Sillago japonica	日本沙鮻	63	601
	F095	Engraulidae	鯷科	Thryssa sp.	綾鯷	24	601
	F510	Diodontidae	二齒魨科	Diodon holocanthus	六斑二齒魨	77	585
	F159	Bagridae	鮠科	Pseudobagrus brevianalis	短臀擬鱨	131	563
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Gen. sp(Sillaginidae)	沙鮻科	101	559
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis interrupta	斷帶紫胸魚	95	557
	F433	Champsodontidae	鱷齒鱚科	Champsodon snyderi	斯氏鱷齒魚	64	543
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius sp.	吻鰕虎	117	539
	F412	Labridae	隆頭魚科	Gen. sp(Labridae)	隆頭魚	58	531
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Gen. sp(Myctophidae)	燈籠魚科	102	530
	F378	Sparidae	鯛科	Gen. sp(Sparidae)	鯛科	59	530
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Gen. sp(Apogonidae)	天竺鯛	117	529
	F474	Trichiuridae	帶魚科	Trichiurus lepturus	白帶魚	130	507
	F102	Cyprinidae	鯉科	Zacco platypus	平頜鱲	85	506
	F102	Cyprinidae	鯉科	Varicorhinus barbatulus	臺灣突吻魚	63	490
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Minous monodactylus	單指虎鮋	23	469
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Hemimyzon formosanus	臺灣間爬岩鰍	92	467
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Gen. sp(Synodontidae)	狗母魚科	78	462
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Bathygobius fuscus	褐深鰕虎	92	439
	F412	Labridae	隆頭魚科	Pseudolabrus eoethinus	紅項擬隆頭魚	55	422
	F447	Blenniidae	鳚科	Istiblennius edentulus	暗紋蛙鳚	148	418
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Crossostoma lacustre	臺灣纓口鰍	112	414
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius giurinus	極樂吻鰕虎	98	410
	F069	Elopidae	海鰱科	Elops machnata	大眼海鰱	80	403
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Chrysiptera glauca	灰刻齒雀鯛	70	390
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis trilineata	三線紫胸魚	119	386
	F074	Anguillidae	鰻鱺科	Anguilla japonica	日本鰻鱺	73	381
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Abudefduf sordidus	梭地豆娘魚	137	366
	F097	Clupeidae	鯡科	Etrumeus micropus	小鱗脂眼鯡	49	356
	F097	Clupeidae	鯡科	Gen. sp(Clupeidae)	鯡科	65	352
	F179	Gonostomatidae	鑽光魚科	Sigmops gracilis	柔身纖鑽光魚	59	351
	F330	Ambassidae	雙邊魚科	Ambassis urotaenia	尾紋雙邊魚	33	345
	F381	Sciaenidae	石首魚科	Johnius grypotus	叫姑魚	9	345
	F502	Cynoglossidae	舌鰨科	Symphurus orientalis	東方無線鰨	96	344
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Apogon cookii	庫氏天竺鯛	83	335
	F102	Cyprinidae	鯉科	Carassius auratus auratus	鯽	149	331
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Saurida undosquamis	花斑蛇鯔	68	327
	F447	Blenniidae	鳚科	Istiblennius lineatus	線紋蛙鳚	116	320
	F399	Terapontidae	鯻科	Terapon jarbua	花身鯻	129	316
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Synodus macrops	大目狗母魚	40	315
	F474	Trichiuridae	帶魚科	Trichiurus japonicus	日本帶魚	57	302
	F502	Cynoglossidae	舌鰨科	Cynoglossus arel	印度舌鰨	30	302
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Sebastiscus marmoratus	石狗公	90	301
	F502	Cynoglossidae	舌鰨科	Cynoglossus interruptus	斷線舌鰨	27	286
	F245	Mugilidae	鯔科	Chelon macrolepis	大鱗龜鮻	91	284
	F102	Cyprinidae	鯉科	Rhodeus ocellatus ocellatus	高體鰟鮍	57	283
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Gen. sp(Pomacentridae)	雀鯛	60	281
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Saurida elongata	長體蛇鯔	59	280
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres margaritaceus	斑點海豬魚	73	278
	F107	Balitoridae	平鰭鰍科	Sinogastromyzon puliensis	埔里中華爬岩鰍	85	273
	F338	Serranidae	鮨科	Epinephelus quoyanus	玳瑁石斑魚	87	272
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Pomacentrus coelestis	霓虹雀鯛	75	271
	F509	Tetraodontidae	四齒魨科	Gen. sp(Tetraodontidae)	魨科	37	266
	F494	Bothidae	鮃科	Gen. sp(Bothidae)	鮃科	98	265
	F332	Moronidae	狼鱸科	Lateolabrax japonicus	日本花鱸	72	265
	F097	Clupeidae	鯡科	Etrumeus teres	脂眼鯡	37	259
	F447	Blenniidae	鳚科	Praealticus tanegasimae	種子島矮冠鳚	70	258
	F453	Callionymidae	鼠䲗科	Gen. sp(Callionymidae)	鼠	60	255
	F097	Clupeidae	鯡科	Sardinella sindensis	信德小沙丁魚	58	255
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Scorpaenodes guamensis	關島小鮋	101	254
	F351	Priacanthidae	大眼鯛科	Priacanthus macracanthus	大棘大眼鯛	86	253
	F023	Scyliorhinidae	貓鯊科	Galeus sauteri	梭氏蜥鯊	87	252
	F378	Sparidae	鯛科	Acanthopagrus latus	黃鰭棘鯛	67	246
	F447	Blenniidae	鳚科	Gen. sp(Blenniidae)	鳚	93	244
	F366	Leiognathidae	鰏科	Photopectoralis bindus	黃斑光胸鰏	59	243
	F457	Eleotridae	塘鱧科	Eleotris acanthopoma	刺蓋塘鱧	94	242
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Chrysiptera biocellata	雙斑刻齒雀鯛	67	236
	F102	Cyprinidae	鯉科	Microphysogobio brevirostris	短吻小鰾鮈	64	236
	F187	Synodontidae	合齒魚科	Harpadon nehereus	印度鐮齒魚	46	231
	F099	Gonorynchidae	鼠鱚科	Gonorynchus abbreviatus	鼠鱚	65	230
	F245	Mugilidae	鯔科	Mugil cephalus	鯔	89	229
	F330	Ambassidae	雙邊魚科	Ambassis interrupta	斷線雙邊魚	35	228
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Chaetodon vagabundus	飄浮蝴蝶魚	90	228
	F097	Clupeidae	鯡科	Spratelloides gracilis	日本銀帶鯡	34	226
	F245	Mugilidae	鯔科	Moolgarda cunnesius	長鰭莫鯔	44	225
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres trimaculatus	三斑海豬魚	80	225
	F486	Osphronemidae	絲足鱸科	Macropodus opercularis	蓋斑鬥魚	72	223
	F453	Callionymidae	鼠䲗科	Bathycallionymus sokonumeri	紋鰭深水	28	220
	F102	Cyprinidae	鯉科	Candidia barbatus	台灣縱紋鱲	72	220
	F354	Sillaginidae	沙鮻科	Sillago sp.	沙鮻	64	217
	F180	Sternoptychidae	褶胸魚科	Polyipnus sp.	燭光魚	28	216
	F159	Bagridae	鮠科	Tachysurus adiposalis	長脂瘋鱨	79	214
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Bathygobius sp.	深鰕虎魚	45	212
	F106	Cobitidae	鰍科	Misgurnus anguillicaudatus	泥鰍	85	211
	F383	Pempheridae	擬金眼鯛科	Pempheris oualensis	烏伊蘭擬金眼鯛	30	210
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres melanochir	黑腕海豬魚	92	209
	F228	Antennariidae	躄魚科	Antennarius striatus	條紋躄魚	111	207
	F335	Acropomatidae	發光鯛科	Acropoma japonicum	日本發光鯛	69	207
	F304	Scorpaenidae	鮋科	Setarches longimanus	長臂囊頭鮋	106	205
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres marginatus	緣鰭海豬魚	91	204
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Plectroglyphidodon leucozonus	白帶固曲齒鯛	77	201
	F467	Siganidae	臭肚魚科科	Siganus fuscescens	褐臭肚魚	84	200
	F306	Aploactinidae	絨皮鮋科	Erisphex pottii	絨鮋	74	199
	F475	Scombridae	鯖科	Gen. sp(Scombridae)	鯖科	33	199
	F095	Engraulidae	鯷科	Stolephorus insularis	島嶼側帶小公魚	34	198
	F036	Etmopteridae	燈籠棘鮫科	Etmopterus lucifer	亮烏鯊	60	195
	F470	Acanthuridae	刺尾鯛科	Acanthurus nigrofuscus	褐斑刺尾鯛	42	195
	F364	Carangidae		Gen. sp(Carangidae)	鰺科	83	193
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Ceratoscopelus warmingii	瓦明氏角燈魚	53	193
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Apogon doederleini	稻氏天竺鯛	69	192
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Asterropteryx semipunctata	半斑星塘鱧	42	190
	F007	Chimaeridae	銀鮫科	Chimaera phantasma	黑線銀鮫	61	190
	F453	Callionymidae	鼠䲗科	Callionymus curvicornis	彎角	39	190
	F102	Cyprinidae	鯉科	Opsariichthys evolans	長鰭馬口鱲	57	189
	F098	Chanidae	虱目魚科	Chanos chanos	虱目魚	55	187
	F366	Leiognathidae	鰏科	Gazza minuta	小牙鰏	76	187
	F106	Cobitidae	鰍科	Cobitis sinensis	中華鰍	54	185
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Istigobius ornatus	飾妝銜鰕虎	57	184
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Rhinogobius gigas	大吻鰕虎	36	183
	F182	Stomiidae	巨口魚科	Astronesthes lucifer	螢光星衫魚	70	182
	F441	Ammodytidae	玉筋魚科	Bleekeria mitsukurii	箕作布氏筋魚	54	182
	F470	Acanthuridae	刺尾鯛科	Acanthurus lineatus	線紋刺尾鯛	66	182
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Diaphus garmani	喀氏眶燈魚	43	180
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Acentrogobius caninus	犬牙細棘鰕虎	30	180
	F412	Labridae	隆頭魚科	Halichoeres miniatus	小海豬魚	49	179
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Heniochus acuminatus	白吻雙帶立旗鯛	70	179
	F001	Myxinidae	盲鰻科	Eptatretus burgeri	布氏黏盲鰻	47	179
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Redigobius bikolanus	拜庫雷鰕虎	36	176
	F079	Muraenidae	鯙科	Echidna polyzona	多環蝮鯙	70	175
	F222	Ophidiidae	鼬魚科	Neobythites stigmosus	多斑新鼬鳚	77	174
	F215	Macrouridae	鼠尾鱈科	Coelorinchus sp.	鼠尾鱈	22	171
	F095	Engraulidae	鯷科	Thryssa dussumieri	杜氏稜鯷	32	171
	F364	Carangidae		Trachurus japonicus	日本竹筴魚	76	168
	F097	Clupeidae	鯡科	Sardinella lemuru	黃澤小沙丁魚	73	168
	F447	Blenniidae	鳚科	Istiblennius dussumieri	杜氏蛙鳚	54	167
	F266	Poeciliidae	花鱂科	Gambusia affinis	食蚊魚	43	167
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Glossogobius olivaceus	點帶叉舌鰕虎	66	166
	F366	Leiognathidae	鰏科	Nuchequula nuchalis	項斑頸鰏	42	165
	F102	Cyprinidae	鯉科	Gobiobotia cheni	陳氏鰍鮀	61	165
	F447	Blenniidae	鳚科	Entomacrodus striatus	橫帶間項鬚鳚	52	165
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Oligolepis acutipennis	尖鰭寡鱗鰕虎	50	164
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Amphiprion clarkii	克氏雙鋸魚	119	163
	F381	Sciaenidae	石首魚科	Pennahia argentata	白姑魚	59	163
	F097	Clupeidae	鯡科	Sardinella jussieu	裘氏小沙丁魚	42	162
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Chaetodon auriga	揚旛蝴蝶魚	69	162
	F394	Pomacanthidae	蓋刺魚科	Pomacanthus semicirculatus	疊波蓋刺魚	90	161
	F457	Eleotridae	塘鱧科	Eleotris fusca	褐塘鱧	60	160
	F400	Kuhliidae	湯鯉科	Kuhlia mugil	鯔形湯鯉	45	160
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Abudefduf septemfasciatus	七帶豆娘魚	49	160
	F373	Gerreidae	鑽嘴魚科	Gerres oyena	奧奈鑽嘴魚	42	160
	F433	Champsodontidae	鱷齒鱚科	Champsodon guentheri	貢氏鱷齒魚	30	159
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Taenioides cirratus	鬚鰻鰕虎	55	159
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Chrysiptera cyanea	藍刻齒雀鯛	17	159
	F400	Kuhliidae	湯鯉科	Gen. sp(Kuhliidae)	湯鯉科	25	158
	F366	Leiognathidae	鰏科	Leiognathus splendens	黑邊鰏	54	158
	F102	Cyprinidae	鯉科	Tanakia himantegus	革條田中鰟鮍	32	157
	F249	Atherionidae	小銀漢魚科	Atherion elymus	糙頭細銀漢魚	16	157
	F460	Gobiidae	鰕虎科	Periophthalmus cantonensis	彈塗魚的異名	30	157
	F412	Labridae	隆頭魚科	Thalassoma purpureum	紫錦魚	72	155
	F200	Myctophidae	燈籠魚科	Diaphus sp.	眶燈魚	45	154
	F443	Uranoscopidae	膽星魚科	Uranoscopus japonicus	日本鰧	78	153
	F102	Cyprinidae	鯉科	Cyprinus carpio carpio	西鯉	77	153
	F412	Labridae	隆頭魚科	Stethojulis bandanensis	黑星紫胸魚	79	153
	F381	Sciaenidae	石首魚科	Atrobucca nibe	黑	81	153
	F001	Myxinidae	盲鰻科	Eptatretus taiwanae	臺灣黏盲鰻	24	151
	F393	Chaetodontidae	蝴蝶魚科	Chaetodon kleinii	克氏蝴蝶魚	51	150
	F213	Bregmacerotidae	海鰗鰍科	Bregmaceros lanceolatus	尖鰭海鰗鰍	41	150
	F196	Paralepididae	裸蜥魚科	Gen. sp(Paralepididae)	裸狗母魚科	37	150
	F352	Apogonidae	天竺鯛科	Taeniamia fucata	褐斑帶天竺鯛	47	149
	F247	Notocheiridae	浪花魚科	Gen. sp(Notocheiridae)	背手銀漢魚科	3	149
	F364	Carangidae		Caranx sexfasciatus	六帶鰺	82	149
	F102	Cyprinidae	鯉科	Aphyocypris kikuchii	菊池氏細鯽	32	149
	F335	Acropomatidae	發光鯛科	Acropoma hanedai	羽根田氏發光鯛	49	148
	F502	Cynoglossidae	舌鰨科	Paraplagusia japonica	日本鬚鰨	17	148
	F222	Ophidiidae	鼬魚科	Neobythites sivicola	黑潮新鼬鳚	67	148
	F399	Terapontidae	鯻科	Pelates quadrilineatus	四帶牙鯻	80	147
	F448	Clinidae	磯鳚科	Springeratus xanthosoma	黃身跳磯鳚	61	147
	F411	Pomacentridae	雀鯛科	Chrysiptera brownriggii	勃氏刻齒雀鯛	39	146
	F509	Tetraodontidae	四齒魨科	Lagocephalus sceleratus	圓斑兔頭魨	52	146
	F435	Pinguipedidae	虎鱚科	Parapercis sexfasciata	六帶擬鱸	77	145