依據臺灣淡水魚類名錄總整理的結果，扣除外來種累計淡水及河口魚類，台灣至少有58科265種的原生淡水魚類，其中包含許多臺灣特有種魚類，然而近年來由於棲地受到人為工程及開發的干擾與破壞，以及外來種的攻擊及競爭，使得許多台灣淡水魚類物種陷入瀕危的狀態。2008年中華民國魚類學會接受林務局委託，進行為期三年的「臺灣地區淡水域湖泊、野塘及溪流魚類現況調查及保育研究規劃」計畫，經過許多專家學者及評審委員的共同討論，評定出52種淡水魚類並出版《臺灣淡水魚類紅皮書》。書中包含有10種已公告的「國家級保育類淡水魚種」，以及初次收錄的42種「其他具瀕危風險之淡水魚種」。該書分成兩節，分別說明紅皮書收錄的各種淡水魚知詳細現況及資訊，作者為陳義雄、曾晴賢及邵廣昭。

• 極危Critically endangered (CR)：某一物種在很短時間內，在野外有面臨滅絕的高度危險，且被認定為極危物種。該書登錄3種。
• 瀕危Endangered (EN)：當某一物種未達到極危標準，但可能在不久的未來，在野外有瀕臨滅絕的危機時，且被認定為瀕危物種。該書登錄3種。
• 易危Vulnerable (VU)：某一物種雖未達到極危或瀕危的標準，但在一個相當長的時間內，在野外會面臨滅絕的危險，且被認定為易危物種。該書登錄15種。
• 接近受脅Near Threatened (NT)：某一物種經過準則的評估後，無法合於極危、瀕危、易危的等級，但已很接近易危等級或是未來可能達到受脅等級。該書登錄31種
• 較少受威脅Least Concern (LC)：某一物種經過準則評估後無法合於極危、瀕危、易危及接近受脅等級，分布廣、數量多的物種屬於這個等級。該書未登錄。