| | | 新鰭魚亞綱 subclass Neopterygii 33目 56亞目 250科 1110屬 2923種 |
| | | | | 海鰱目 order Elopiformes 1亞目 2科 2屬 2種 |
|
| | | | | 狐鰮目 order Albuliformes 2亞目 3科 6屬 8種 |
|
| | | | | 鰻形目 order Anguilliformes 3亞目 12科 66屬 167種 |
|
| | | | | 囊鰓鰻目 order Saccopharyngiformes 1亞目 1科 1屬 1種 |
|
| | | | | 鯡形目 order Clupeiformes 1亞目 4科 22屬 49種 |
|
| | | | | 鼠鱚目 order Gonorhynchiformes 2亞目 2科 2屬 2種 |
|
| | | | | 鯉形目 order Cypriniformes 1亞目 3科 38屬 55種 |
|
| | | | | 鯰形目 order Siluriformes 1亞目 7科 10屬 14種 |
|
| | | | | 水珍魚目 order Argentiniformes 2亞目 3科 13屬 17種 |
|
| | | | | 胡瓜魚目 order Osmeriformes 1亞目 1科 2屬 2種 |
|
| | | | | 鮭形目 order Salmoniformes 1亞目 1科 1屬 2種 |
|
| | | | | 巨口魚目 order Stomiiformes 3亞目 5科 33屬 59種 |
|
| | | | | 軟腕魚目 order Ateleopodiformes 1亞目 1科 2屬 4種 |
|
| | | | | 仙女魚目 order Aulopiformes 4亞目 10科 16屬 42種 |
|
| | | | | 燈籠魚目 order Myctophiformes 1亞目 2科 19屬 54種 |
|
| | | | | 月魚目 order Lampridiformes 1亞目 5科 8屬 9種 |
|
| | | | | 銀眼鯛目 order Polymixiiformes 1亞目 1科 1屬 3種 |
|
| | | | | 鱈形目 order Gadiformes 1亞目 3科 27屬 89種 |
|
| | | | | 鼬魚目 order Ophidiiformes 2亞目 4科 31屬 48種 |
|
| | | | | 鮟鱇目 order Lophiiformes 3亞目 15科 33屬 66種 |
|
| | | | | 鯔形目 order Mugiliformes 1亞目 1科 6屬 12種 |
|
| | | | | 銀漢魚目 order Atheriniformes 1亞目 3科 4屬 9種 |
|
| | | | | 鶴鱵目 order Beloniformes 2亞目 4科 17屬 46種 |
|
| | | | | 鱂形目 order Cyprinodontiformes 1亞目 1科 3屬 6種 |
|
| | | | | 奇金眼鯛目 order Stephanoberyciformes 1亞目 4科 5屬 6種 |
|
| | | | | 金眼鯛目 order Beryciformes 3亞目 6科 17屬 51種 |
|
| | | | | 的鯛目 order Zeiformes 1亞目 4科 8屬 10種 |
|
| | | | | 刺魚目 order Gasterosteiformes 1亞目 7科 28屬 56種 |
|
| | | | | 合鰓魚目 order Synbranchiformes 2亞目 2科 2屬 2種 |
|
| | | | | 鮋形目 order Scorpaeniformes 4亞目 13科 73屬 167種 |
|
| | | | | 鱸形目 order Perciformes 14亞目 102科 521屬 1647種 | | | | | | 鱸亞目 suborder Percoidei 56科 240屬 742種 |
| | | | | | 隆頭魚亞目 suborder Labroidei 4科 66屬 287種 | | | | | | 麗魚科 409 Family Cichlidae 5屬 7種 |
| | | | | | 雀鯛科 411 Family Pomacentridae 18屬 104種 | | | | | | | | | 寬刻齒雀鯛屬 Genus Amblyglyphidodon 4種 |
| | | | | | 鈍雀鯛屬 Genus Amblypomacentrus 1種 |
| | | | | | | | | 厚唇雀鯛屬 Genus Cheiloprion 1種 |
| | | | | | 光鰓雀鯛屬 Genus Chromis 28種 | | | | | | 侏儒光鰓雀鯛(侏儒光鰓魚) Chromis acares Randall & Swerdloff, 1973 |
| | | | | | 白尾光鰓雀鯛(白尾光鰓魚) Chromis albicauda Allen & Erdmann, 2009 |
| | | | | | 白斑光鰓雀鯛(白斑光鰓魚) Chromis albomaculata Kamohara, 1960 |
| | | | | | 亞倫氏光鰓雀鯛(艾倫光鰓魚) Chromis alleni Randall, Ida & Moyer, 1981 |
| | | | | | 長臀光鰓雀鯛(長臀光鰓魚) Chromis analis (Cuvier, 1830) |
| | | | | | 黑腋光鰓雀鯛(綠光鰓魚) Chromis atripectoralis Welander & Schultz, 1951 |
| | | | | | 黑鰭光鰓雀鯛(腋斑光鰓魚) Chromis atripes Fowler & Bean, 1928 |
| | | | | | 短身光鰓雀鯛(長棘光鰓魚) Chromis chrysura (Bliss, 1883) |
| | | | | | 灰光鰓雀鯛(灰光鰓魚) Chromis cinerascens (Cuvier, 1830) |
| | | | | | 三角光鰓雀鯛(三角光鰓魚) Chromis delta Randall, 1988 |
| | | | | | 黑肛光鰓雀鯛(黑肛光鰓魚) Chromis elerae Fowler & Bean, 1928 |
| | | | | | 黃斑光鰓雀鯛(黃斑光鰓魚) Chromis flavomaculata Kamohara, 1960 |
| | | | | | 燕尾光鰓雀鯛(煙色光鰓魚) Chromis fumea (Tanaka, 1917) |
| | | | | | 細鱗光鰓雀鯛(細鱗光鰓魚) Chromis lepidolepis Bleeker, 1877 |
| | | | | | 亮光鰓雀鯛(亮光鰓魚) Chromis leucura Gilbert, 1905 |
| | | | | | 雙斑光鰓雀鯛(雙斑光鰓魚) Chromis margaritifer Fowler, 1946 |
| | | | | | 橫帶光鰓雀鯛(東海光鰓魚) Chromis mirationis Tanaka, 1917 |
| | | | | | 尾斑光鰓雀鯛(尾斑光鰓魚) Chromis notata (Temminck & Schlegel, 1843) |
| | | | | | 岡村氏光鰓雀鯛(岡村氏光鰓魚) Chromis okamurai Yamakawa & Randall, 1989 |
| | | | | | 大沼氏光鰓雀鯛(大沼氏光鰓魚) Chromis onumai Senou & Kudo, 2007 |
| | | | | | 卵形光鰓雀鯛(卵形光鰓魚) Chromis ovatiformes Fowler, 1946 |
| | | | | | 黑帶光鰓雀鯛(黑帶光鰓魚) Chromis retrofasciata Weber, 1913 |
| | | | | | 三葉光鰓雀鯛(條尾光鰓魚) Chromis ternatensis (Bleeker, 1856) |
| | | | | | 凡氏光鰓雀鯛(凡氏光鰓魚) Chromis vanderbilti (Fowler, 1941) |
| | | | | | 藍綠光鰓雀鯛(藍綠光鰓魚) Chromis viridis (Cuvier, 1830) |
| | | | | | 魏氏光鰓雀鯛(韋氏光鰓魚) Chromis weberi Fowler & Bean, 1928 |
| | | | | | 黃腋光鰓雀鯛(黃腋光鰓魚) Chromis xanthochira (Bleeker, 1851) |
| | | | | | 黃尾光鰓雀鯛(黃尾光鰓魚) Chromis xanthura (Bleeker, 1854) |
|
| | | | | | 刻齒雀鯛屬 Genus Chrysiptera 9種 |
| | | | | | | | | 盤雀鯛屬 Genus Dischistodus 3種 |
| | | | | | 密鰓魚屬 Genus Hemiglyphidodon 1種 |
| | | | | | 新刻齒雀鯛屬 Genus Neoglyphidodon 2種 |
| | | | | | 新雀鯛屬 Genus Neopomacentrus 3種 |
| | | | | | 固曲齒鯛屬 Genus Plectroglyphidodon 6種 |
| | | | | | 雀鯛屬 Genus Pomacentrus 17種 |
| | | | | | 波光鰓雀鯛屬 Genus Pomachromis 1種 |
| | | | | | | | | | | | 細鱗雀鯛屬 Genus Teixeirichthys 1種 |
|
| | | | | | 隆頭魚科 412 Family Labridae 36屬 143種 |
| | | | | | 鸚哥魚科 414 Family Scaridae 7屬 33種 |
|
| | | | | | 綿鳚亞目 suborder Zoarcoidei 2科 2屬 3種 |
| | | | | | 鱷鱚亞目 suborder Trachinoidei 8科 17屬 55種 |
| | | | | | 鳚亞目 suborder Blennioidei 4科 32屬 100種 |
| | | | | | 喉盤魚亞目 suborder Gobiesocoidei 1科 7屬 7種 |
| | | | | |  亞目 suborder Callionymoidei 2科 10屬 40種 |
| | | | | | 鰕虎亞目 suborder Gobioidei 7科 93屬 279種 |
| | | | | | 刺尾魚亞目 suborder Acanthuroidei 5科 11屬 59種 |
| | | | | | 鯖亞目 suborder Scombroidei 6科 32屬 54種 |
| | | | | | 鯧亞目 suborder Stromateoidei 4科 7屬 14種 |
| | | | | | 攀鱸亞目 suborder Anabantoidei 1科 2屬 2種 |
| | | | | | 鱧亞目 suborder Channoidei 1科 1屬 3種 |
| | | | | | 羊魴亞目 suborder Caproidei 1科 1屬 2種 |
|
|
| | | | | 鰈形目 order Pleuronectiformes 2亞目 9科 41屬 104種 |
|
| | | | | 魨形目 order Tetraodontiformes 3亞目 9科 52屬 114種 |
|
台灣魚類分類階層樹狀名錄
3綱 4亞綱 48目 61亞目 298科 1209屬 3121種 (2018-10-16 更新) 資料庫改版中，此頁面以不更新，新版名錄請從新版分類系統
