| | | 新鰭魚亞綱 subclass Neopterygii 33目 56亞目 250科 1110屬 2923種 |
| | | | 海鰱目 order Elopiformes 1亞目 2科 2屬 2種 |
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| | | | 狐鰮目 order Albuliformes 2亞目 3科 6屬 8種 |
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| | | | 鰻形目 order Anguilliformes 3亞目 12科 66屬 167種 |
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| | | | 囊鰓鰻目 order Saccopharyngiformes 1亞目 1科 1屬 1種 |
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| | | | 鯡形目 order Clupeiformes 1亞目 4科 22屬 49種 |
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| | | | 鼠鱚目 order Gonorhynchiformes 2亞目 2科 2屬 2種 |
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| | | | 鯉形目 order Cypriniformes 1亞目 3科 38屬 55種 |
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| | | | 鯰形目 order Siluriformes 1亞目 7科 10屬 14種 |
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| | | | 水珍魚目 order Argentiniformes 2亞目 3科 13屬 17種 |
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| | | | 胡瓜魚目 order Osmeriformes 1亞目 1科 2屬 2種 |
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| | | | 鮭形目 order Salmoniformes 1亞目 1科 1屬 2種 |
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| | | | 巨口魚目 order Stomiiformes 3亞目 5科 33屬 59種 |
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| | | | 軟腕魚目 order Ateleopodiformes 1亞目 1科 2屬 4種 |
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| | | | 仙女魚目 order Aulopiformes 4亞目 10科 16屬 42種 |
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| | | | 燈籠魚目 order Myctophiformes 1亞目 2科 19屬 54種 |
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| | | | 月魚目 order Lampridiformes 1亞目 5科 8屬 9種 |
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| | | | 銀眼鯛目 order Polymixiiformes 1亞目 1科 1屬 3種 |
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| | | | 鱈形目 order Gadiformes 1亞目 3科 27屬 89種 | | | | | 海鰗鰍科 213 Family Bregmacerotidae 1屬 5種 |
| | | | | 鼠尾鱈科 215 Family Macrouridae 20屬 72種 | | | | | | | | | 腔吻鱈屬 Genus Coelorinchus 21種 | | | | | 鴨嘴腔吻鱈 Coelorinchus anatirostris Jordan & Gilbert, 1904 |
| | | | | 擬星腔吻鱈 Coelorinchus asteroides Okamura, 1963 |
| | | | | 短吻腔吻鱈 Coelorinchus brevirostris Okamura, 1984 |
| | | | | 帶斑腔吻鱈 Coelorinchus cingulatus Gilbert & Hubbs, 1920 |
| | | | | 變異腔吻鱈 Coelorinchus commutabilis Smith & Radcliffe, 1912 |
| | | | | 廣佈腔吻鱈 Coelorinchus divergens Okamura & Yatou, 1984 |
| | | | | 臺灣腔吻鱈 Coelorinchus formosanus Okamura, 1963 |
| | | | | 黑喉腔吻鱈 Coelorinchus fuscigulus Iwamoto, Ho & Shao, 2009 |
| | | | | 哈氏腔吻鱈 Coelorinchus hubbsi Matsubara, 1936 |
| | | | | 日本腔吻鱈 Coelorinchus japonicus (Temminck & Schlegel, 1846) |
| | | | | 蒲原氏腔吻鱈 Coelorinchus kamoharai Matsubara, 1943 |
| | | | | 岸上氏腔吻鱈 Coelorinchus kishinouyei Jordan & Snyder, 1900 |
| | | | | 窄吻腔吻鱈 Coelorinchus leptorhinus Chiou, Shao & Iwamoto, 2004 |
| | | | | 長管腔吻鱈 Coelorinchus longissimus Matsubara, 1943 |
| | | | | 大臂腔吻鱈 Coelorinchus macrochir (Günther, 1877) |
| | | | | 多棘腔吻鱈 Coelorinchus multispinulosus Katayama, 1942 |
| | | | | 平棘腔吻鱈 Coelorinchus parallelus (Günther, 1877) |
| | | | | 東海腔吻鱈 Coelorinchus productus Gilbert & Hubbs, 1916 |
| | | | | 沈氏腔吻鱈 Coelorinchus sheni Chiou, Shao & Iwamoto, 2004 |
| | | | | 史氏腔吻鱈 Coelorinchus smithi Gilbert & Hubbs, 1920 |
| | | | | 大棘腔吻鱈 Coelorinchus spinifer Gilbert & Hubbs, 1920 |
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| | | | | 突吻鱈屬 Genus Coryphaenoides 5種 |
| | | | | | | 膜首鱈屬 Genus Hymenocephalus 4種 |
| | | | | | | 庫隆長尾鱈屬 Genus Kuronezumia 1種 |
| | | | | | | | | 軟首鱈屬 Genus Malacocephalus 2種 |
| | | | | 愚首鱈屬 Genus Mataeocephalus 2種 |
| | | | | | | 擬櫛尾鱈屬 Genus Pseudocetonurus 1種 |
| | | | | 擬奈氏鱈屬 Genus Pseudonezumia 1種 |
| | | | | 短吻鼠尾鱈屬 Genus Sphagemacrurus 3種 |
| | | | | 鏢吻鱈屬 Genus Spicomacrurus 1種 |
| | | | | 卵首鱈屬 Genus Squalogadus 1種 |
| | | | | 粗尾鱈屬 Genus Trachonurus 2種 |
| | | | | 凹腹鱈屬 Genus Ventrifossa 8種 |
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| | | | | 稚鱈科 216 Family Moridae 6屬 12種 |
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| | | | 鼬魚目 order Ophidiiformes 2亞目 4科 31屬 48種 |
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| | | | 鮟鱇目 order Lophiiformes 3亞目 15科 33屬 66種 |
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| | | | 鯔形目 order Mugiliformes 1亞目 1科 6屬 12種 |
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| | | | 銀漢魚目 order Atheriniformes 1亞目 3科 4屬 9種 |
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| | | | 鶴鱵目 order Beloniformes 2亞目 4科 17屬 46種 |
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| | | | 鱂形目 order Cyprinodontiformes 1亞目 1科 3屬 6種 |
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| | | | 奇金眼鯛目 order Stephanoberyciformes 1亞目 4科 5屬 6種 |
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| | | | 金眼鯛目 order Beryciformes 3亞目 6科 17屬 51種 |
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| | | | 的鯛目 order Zeiformes 1亞目 4科 8屬 10種 |
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| | | | 刺魚目 order Gasterosteiformes 1亞目 7科 28屬 56種 |
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| | | | 合鰓魚目 order Synbranchiformes 2亞目 2科 2屬 2種 |
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| | | | 鮋形目 order Scorpaeniformes 4亞目 13科 73屬 167種 |
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| | | | 鱸形目 order Perciformes 14亞目 102科 521屬 1647種 |
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| | | | 鰈形目 order Pleuronectiformes 2亞目 9科 41屬 104種 |
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| | | | 魨形目 order Tetraodontiformes 3亞目 9科 52屬 114種 |
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