| | | 鱸亞目 suborder Percoidei 56科 240屬 742種 |
| | | | | 雙邊魚科 330 Family Ambassidae 2屬 7種 |
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| | | | | 尖吻鱸科 331 Family Latidae 2屬 2種 | | | | | | | | | 沙鱸屬 Genus Psammoperca 1種 | | | | | | 紅眼沙鱸 Psammoperca waigiensis (Cuvier, 1828) |
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| | | | | 狼鱸科 332 Family Moronidae 1屬 1種 |
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| | | | | 真鱸科 333 Family Percichthyidae 2屬 2種 |
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| | | | | 發光鯛科 335 Family Acropomatidae 5屬 13種 |
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| | | | | 癒齒鯛科 336 Family Symphysanodontidae 1屬 2種 |
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| | | | | 鮨科 338 Family Serranidae 31屬 121種 |
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| | | | | 巨棘鱸科 340 Family Ostracoberycidae 1屬 1種 |
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| | | | | 麗花鮨科 341 Family Callanthiidae 1屬 1種 |
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| | | | | 擬雀鯛科 342 Family Pseudochromidae 5屬 12種 |
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| | | | | 七夕魚科 344 Family Plesiopidae 6屬 11種 |
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| | | | | 後頜魚科 346 Family Opistognathidae 2屬 7種 |
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| | | | | 扁棘鯛科 348 Family Banjosidae 1屬 1種 |
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| | | | | 棘臀魚科 349 Family Centrarchidae 1屬 1種 |
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| | | | | 大眼鯛科 351 Family Priacanthidae 4屬 10種 |
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| | | | | 天竺鯛科 352 Family Apogonidae 26屬 89種 |
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| | | | | 深海天竺鯛科 353 Family Epigonidae 1屬 1種 |
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| | | | | 沙鮻科 354 Family Sillaginidae 1屬 8種 |
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| | | | | 弱棘魚科 355 Family Malacanthidae 3屬 11種 |
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| | | | | 乳鯖科 356 Family Lactariidae 1屬 1種 |
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| | | | | 鯥科 358 Family Scombropidae 1屬 1種 |
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| | | | | 扁鰺科 359 Family Pomatomidae 1屬 1種 |
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| | | | | 鱰科 361 Family Coryphaenidae 1屬 2種 |
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| | | | | 海鱺科 362 Family Rachycentridae 1屬 1種 |
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| | | | | 鮣科 363 Family Echeneidae 2屬 6種 |
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| | | | | 鰺科 364 Family Carangidae 22屬 56種 |
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| | | | | 眼眶魚科 365 Family Menidae 1屬 1種 |
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| | | | | 鰏科 366 Family Leiognathidae 8屬 19種 |
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| | | | | 烏魴科 367 Family Bramidae 6屬 8種 |
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| | | | | 諧魚科 369 Family Emmelichthyidae 2屬 3種 |
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| | | | | 笛鯛科 370 Family Lutjanidae 10屬 52種 |
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| | | | | 烏尾鮗科 371 Family Caesionidae 3屬 11種 |
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| | | | | 松鯛科 372 Family Lobotidae 1屬 1種 |
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| | | | | 鑽嘴魚科 373 Family Gerreidae 2屬 11種 |
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| | | | | 石鱸科 374 Family Haemulidae 5屬 22種 |
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| | | | | 金線魚科 376 Family Nemipteridae 4屬 26種 |
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| | | | | 龍占魚科 377 Family Lethrinidae 5屬 24種 |
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| | | | | 鯛科 378 Family Sparidae 7屬 15種 |
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| | | | | 馬鮁科 380 Family Polynemidae 3屬 7種 |
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| | | | | 石首魚科 381 Family Sciaenidae 12屬 22種 |
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| | | | | 鬚鯛科 382 Family Mullidae 3屬 23種 |
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| | | | | 擬金眼鯛科 383 Family Pempheridae 2屬 6種 |
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| | | | | 葉鯛科 384 Family Glaucosomatidae 1屬 1種 |
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| | | | | 深海鯡科 386 Family Bathyclupeidae 1屬 1種 |
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| | | | | 銀鱗鯧科 387 Family Monodactylidae 1屬 1種 |
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| | | | |  科 391 Family Kyphosidae 3屬 7種 |
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| | | | | 雞籠鯧科 392 Family Drepaneidae 1屬 2種 |
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| | | | | 蝴蝶魚科 393 Family Chaetodontidae 6屬 46種 |
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| | | | | 蓋刺魚科 394 Family Pomacanthidae 7屬 29種 |
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| | | | | 五棘鯛科 396 Family Pentacerotidae 3屬 3種 |
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| | | | | 鯻科 399 Family Terapontidae 4屬 6種 |
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| | | | | 湯鯉科 400 Family Kuhliidae 1屬 3種 |
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| | | | | 石鯛科 401 Family Oplegnathidae 1屬 2種 |
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| | | | |  科 402 Family Cirrhitidae 6屬 11種 |
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| | | | | 唇指科 405 Family Cheilodactylidae 1屬 3種 |
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| | | | | 赤刀魚科 407 Family Cepolidae 5屬 7種 |
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台灣魚類分類階層樹狀名錄
3綱 4亞綱 48目 61亞目 298科 1209屬 3121種 (2018-10-16 更新) 資料庫改版中，此頁面以不更新，新版名錄請從新版分類系統
亞目 suborder Callionymoidei 2科 10屬 40種