| 陳健霖, 2008, 台灣及菲律賓蝟蝦次目之分類研究 Taxonomic Studies on the Stenopodiea shrimps ( Crustacea: Decapoda: Stenopodidea) of Taiwan and the Philippines, 國立台灣海洋大學海洋生物研究所碩士學位論文 |
| 王玟琦, 2008, 漁獲壓力對於台灣東北部海域大眼鯛生殖與成長之影響 Fishing impact on maturation and growth of the big eye, Priacanthus macracanthus, in waters off northeastern Taiwan, 國立台灣海洋大學海洋生物研究所碩士學位論文 |
| 張美瑜, 2008, 利用耳石元素指紋圖研究仔稚魚在河口間的擴散糢式-以鰕虎與鯛科為例 Use of otolith elemental signature to study the dispersal patterns of fish larvae among estuaries - a case study of Gobioidei and Sparidae, 國立台灣大學海業科學研究所博士學位論文 |
| 黃祥麟, 2008, Comparative Studies of Life History Strategies in Cetaceans., 國立台灣大學生態與演化生物學研究所博士論文. |
| 劉藍玉, 2009, 長蠹科(鞘翅目)科級系統分類研究 Systematic study of Bostrichidae (Coleoptera) in family category., 國立中興大學昆蟲學系博士論文. |
| 林弘都, 2008, 台灣與中國大陸地區鯉科魚類之親緣地理研究 Phylogeography of Cyprinidae fishes in Taiwan and mainland China, 國立成功大學生命科學研究所博士學位論文 |
| 陳俊余, 2008, 台灣東北部沿岸Spirotontonia taiwanica形態與小次單位核醣體DNA序列比對之研究 Spirotontonia taiwanica n. sp. (Ciliophora: Oligotrichida) from the Coastal Waters of Northeastern Taiwan: Morphology and Small Subunit Ribosomal DNA Sequence, 國立台灣海洋大學環境生物與漁業科學學系碩士學位論文 |
| 劉文宏, 2006, 貢寮地區漁業永續發展指標系統之研究(初稿) Study on Sustainable Development Indicator System of Marine Fisheries in Gungliau , 國立台灣海洋大學環境生物與漁業科學學系博士論文 |
| 陳君睿, 2009, 以耳石微細構造及微化學研究台灣東北海域黑頭魚之生活史 Use of otolith microstructure and microchemistry to study life history of the slickhead Alepocephalus bicolor in the northeastern water off Taiwan, 國立台灣海洋大學海洋生物研究所碩士學位論文 |
| 張榮樺, 2008, 利用生命條碼方法從事台灣海域魚卵早期生活史之分類研究 Taxonomic Studies on Early Stages of Fishes in the Waters off Taiwan by DNA Barcoding Methods , 國立台灣大學生命科學院動物學研究所碩士學位論文 |