內容摘要：

台灣海洋生物的多樣性很高，源自於周遭多樣的海洋環境。台灣具有極佳的地理位置，位於歐亞大陸板塊與陸棚區的邊緣，同時擁有深海與陸棚的海洋環境。台灣海峽的海底下都是沙泥，因此擁有沙泥生態系。全世界雖然有六十幾個海洋國家，但其中只有二十幾個擁有深海，很幸運台灣就是其中之一。台灣地理位置上的優勢不僅如此，因為位在全世界海洋物種最繁盛的地區，也就是東印度群島區，又稱「珊瑚大三角」，由菲律賓、印尼、婆羅洲、新幾內亞等區構成的三角形，雖然台灣不在裡面，卻處在一個頂點的位置，物種多樣性極高，遠勝於第二多的加勒比海海域。當位置處於生態系交匯處，生態系種類就會多，台灣就是最好的例子。

由於不同國家間可能擁有相似的型態的沿岸生態系，國際間推行大海洋生態系，根據水質、水文、生態系，將沿岸生態系劃分成六十六個，有利於整合性管理。細數台灣所擁有的沿岸生態系，珊瑚礁生態常見於，墾丁、部分北部海岸、以及各離島。紅樹林生態系，於西海岸為主，從關渡到枋寮的河口地區。沙灘生態系，屬西海岸最多。沙洲、潟湖，最著名的為七股；南海東沙群島是珊瑚礁潟湖；而岩礁岸則是台灣東邊較多。

台灣的海岸線本島只有一千一百公里。但擁有多樣化的生態系。台灣海峽大概五十公尺深，多為沙泥底棲性的魚類，而東岸深度可以到幾千公尺，有奇特的深海魚類，大洋則有旗魚、鮪魚、翻車魚、鯨豚等。南北部的生物也有所差異，同種生物其實有外型和習性上的不同，這也是台灣分別設立南北兩座海洋博物館的原因之一。

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